[Návod] Hledání léku na koronavirus s použitím PC nebo mining hardware #přepnito

Vědci potřebují nasimulovat obrovské množství variant vazby proteinu na receptor, aby mohli optimalizovat účinnou látku vznikajícího léku. Výpočetní výkon tohoto projektu, který je využíván vývojovými týmy pro výpočty a simulace při výzkumu léčebných látek na léčbu rakoviny, Alzheimerovy, Parkinsonovy a Huntingtonovy choroby, nyní bude sloužit i pro výzkum SARS-CoV-2.  

Jak to funguje?  

Projekt Folding@home je již devatenáct let fungující výpočetní grid tvořený obrovským množstvím klasických domácích počítačů. Ty pomocí speciálního softwaru nabízí uživatelem právě nevyužívaný výpočetní výkon – software z řídícího serveru přijme „zakázku“, tu zpracuje a na server pošle zpět výsledek. A takto stále dokola.  

Díky obrovskému množství zapojených počítačů patří Folding@Home mezi nejvýkonnější superpočítače světa. A nyní se můžete připojit i vy. Velmi jednoduché a v současné době enormně potřebné.  

Uživatel si může nastavit, kolik výkonu dá gridu k dispozici během běžného provozu, nebo zda dá výkon k dispozici jen v době, kdy u počítače nesedí (počítač nic nedělá) a výkon tak nepotřebuje.  

Jak se připojit k Folding@home s počítačem

Pokud máte Mac, nebo Windows, je to jednoduché. 

• Jděte na stránky https://foldingathome.org/start-folding/ a stáhněte si klienta pro svůj OS.  
• Při instalaci nezapomeň zadat team number – 237748 a přidejte se k  našemu teamu WCA Holding! 

Balíček je rozdělen na 3 části 

1. FAHClient je služba, na které to všechno běží. 
2. FAHControl je nástroj, pomocí kterého můžete sledovat a konfigurovat běh aplikace.       
3. FAHViewer je aplikace, která vám zobrazí 3D model proteinu, na kterém právě probíhá výpočet. Viz úvodní fotka článku. 

Windows

Po spuštění FAHControl nastavte, jak moc chcete, aby program využíval váš hardware, případně jestli chcete, aby počítač využíval jen, když jej nepoužíváte. 

Peněženky nastavovat nemusíte, pokud nechcete těžit. Výnosnost je úplně zanedbatelná. 

Můžete využít i grafickou kartu vašeho PC

Pokud máte grafickou kartu, můžete využít i ji. Na Macu vám fungovat nejspíš nebudou, ale na Windows a v Linuxu ano. Stačí, když stisknete „Configure“ – „Slots“ – „Add“ – přepnete na GPU, zvolíte GPU index – většinou „0“, nebo „-1“ a potvrdíte OK. Pokud máte GPU více, budete muset ke každé přiřadit index. Takže gpu-index = 0, OpenCL-index=0 a cuda-index=0. U další GPU bude místo 0 – 1, pak 2, 3 a tak dále. Pokud by vám to nefungovalo, zkuste restartovat PC. Pokud by to ani tak nefungovalo, musíte nastavit config.xml podle tohoto: https://github.com/Bwooce/folding-at-home/blob/master/config.xml

Následující řádek zkopírujete tolikrát, kolik máte karet/slotů. 

  <slot id=’1′ type=’GPU’/> 

V linuxu je najdete pod  /etc/fahclient/config.xml, na windowsech bude ve složce, kde se nainstalovala aplikace. 

Nastavení těžební farmy

Pokud těžíte kryptoměny a chtěli byste přepnout farmu na FAH, důrazně doporučuji použít HIVEOS (referall). Myslím, že pro 3 rigy je zdarma, ale pokud máte více rigů, ten komfort je k nezaplacení. Systém stačí  stáhnout a .iso nainstalovat na disk pomocí nástroje rufus.ie, nabootovat, přihlásit se ke svému účtu, zadat peněženku, přidat rigy a je hotovo. 

Hive OS quick start
 https://www.youtube.com/watch?v=RkgwInOvPIo 

Konfiguraci Hive pro FAH najdete tady:
 https://forum.hiveos.farm/t/join-the-fight-against-the-covid-19-infection/14928 

Linux

Pokud byste se přesto rozhodli instalovat Linux, tak můžete zase použít distribuci HIVE. Je to dost osekaný linux, musí se instalovat přes terminál, ale dá se snadno nainstalovat přes Rufus. Pokud byste zvolili třeba Ubuntu, čeká vás klasická instalace, ale jádro je stejné.  

Návod na instalaci při použití Linuxu

• Nejprve updatujete systém 

Sudo apt-get update 

• Nainstalujete ovladače  

sudo add-apt-repository ppa:graphics-drivers/ppa 

• Pokud to nejde, tak nainstalujete tyto knihovny 

sudo apt-get install software-properties–common 

• Stáhnete instalační balíčky a otevřete složku, ve které jsou 

Cd /root/ 

• Rozbalíte 

Sudo dpkg -l —force-depends fahclient2.2.deb 

Sudo dpkg -l —force-depends fahcontrol2.2.deb 

Nemusíte ten název vypisovat celý, stačí napsat kousek a stisknout klávesu TAB a zbytek se doplní 😉 

• Nainstalujete knihovny pro python 

sudo apt-get install python-gnome2 

• Nainstalujete zbytek 

sudo apt-get -f install 

• Updatujete systém 

sudo apt-get update 

• Pokud nemáte textový editor nainstalujete gedit, ale stačí vám i nano 

Sudo apt-get install gedit 

• Otevřete config.xml a nastavíte CPU a GPU podle tohoto: 

https://github.com/Bwooce/folding-at-home/blob/master/config.xml

sudo gedit /etc/fahclient/config.xml 

• Spustíte Client a Control 

Sudo FAHClient 

Sudo FAHControl 

A foldujete!

Pokud máte strojů více, mohlo by vás svádět nainstalovat si systém na USB disk, nakonfigurovat a pak disk naklonovat. Zkoušel jsem to všemi různými způsoby a klon byl vždycky hrozně nestabilní. Windows si s  tím neporadí vůbec. Clonezilla často nenamountovala disky a když už je zkopírovala, tak nenačetly ani MBR přesto, že to byly bitová kopie.  

Podařilo se mi to naklonovat přes dd (disk destroyer :D), ale klony byly hrozně nestabilní.  

Kdybyste to chtěli zkusit, tak pak dejte vědět, jestli se vám to povedlo. Kopíroval jsem to na obyčejné usb flashky, ssd jsem nezkoušel. 

Zjistíme, jak se jmenují disky. Tady fakt opatrně co kopírujete kam, nedá se to vrátit! Proto „disk destroyer“ 😀 

fdisk -l 

• Použijeme dd 

sudo dd if=/dev/sda6 of=/dev/sdb3 bs=1M  

if = zdrojový disk – sda6 

of= cílový disk – sdb3 

bs=rychlost – 1MB/s 

A pak už jen čekat a čekat a čekat 😀 

Nejsem žádný Linux guru, takže si od vás rád nechám poradit. Doufám, že mě v  komentářích zahltíte tím, co mám špatně, co byste udělali lépe a jak to děláte vy, ať můžeme článek doplnit. Snad vám návod pomohl. Nezapomeňte se přidat k našemu teamu 237748 WCA Holding a sdílet, že pomáháte s  hashtagem #přepnito 

Společně to zvládneme!

• Linux FAH Guide – Part 1: Installing the Operating System  – na YouTube
• Linux FAH Guide – Part 2: Installing the FAH Client – na YouTube
• Folding Rig Remote Access Setup – na YouTube